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中央研究院是民国的最高学术研究机构。蔡元培先生于年受命组建中研院，后来形成了14个院所，其中史语所是当时所有理工类背景院所中唯一的文科院所，据说是傅斯年当时游说蔡元培才组建的。

蔡元培作为中研院的创始院长，给14个院所留下了一个各院所独立自由的传统，即使作为院长的蔡元培对下属的14个院所也只能是劝说，而不能用行政命令。这是自由主义知识分子的传统。

中研院是自由派知识分子唯一的名山事业，向来秉持学术独立和思想自由，不受国民党党文化的影响和支配。中研院”曾经比较多地学习了西方学术建设的传统，院士制度是其中的一个环节。从此奠定和形成学统。

在年评选了81位中央研究院院士，其中数理组院士28人，生物组院士25人，人文组院士28人。这也是大陆第一届且是唯一一届院士选举，选举秉持学术独立自由原则，首届评议员主要由学者组成，代表了当时学术界的最高水平，官僚在其间并不占据重要位置，这样他们的决策可以真正代表学术界，不至于仅仅成为政府的传声筒。不参考政治影响和意识形态等因素，只以学术成就为唯一原则。比如胡适、傅斯年、董作宾就提名郭沫若和马寅初。

郭氏颜色当时人是知道的，但是鉴于他在甲骨上的成就，胡适排除朱家骅代院长的要将郭沫若去名的建议，还是提名了郭沫若。对于郭沫若人品，胡适更是明白和透彻，他把这个曾当着徐志摩等友人的面，当众亲吻自己的“这个小孩子”看得极为透彻，但还是选举郭沫若。这在现在的我们是非常难以理解的。可见当时学术人的胸怀和风骨。

即使后来南京城被攻破，陈毅看到院士名单，居然有郭沫若，也是惊讶不已。

但是，到了年，仅喘息了2年多时间，这些经历南渡北归的的知识分子，又开始伤别离。在历史的大动荡中，中研院院士也一分为三，连同所有的情谊一并斩断，在中原绵延千年的中华文化开始大迁徙。

李济、董作宾、王世杰、傅斯年、朱家骅吴稚晖等10人去往台湾；

陈省身、赵元任、吴大猷、胡适等12人远走海外；

华罗庚、茅以升、金岳霖、冯友兰、梁思永、梁思成、陶孟和等近60人留在大陆。

而中央研究院14个院所，只有傅斯年的史语所完整的搬到台湾，其余院所经内部投票后都是拒绝搬迁。他们也是在遵循蔡元培的这个传统。

中研院其他院所的拒绝搬迁，令负责中研院迁台工作的傅斯年感伤不已。当时余英时的弟子王汎森曾感伤的回忆他的老校长傅斯年：“在台湾后，傅斯年的头发全白了，这都是纷乱的时局造成的。”

民国违心地留下了一大批知识分子，国民政府原计划是让这些知识分子去台湾或海外的。这些留下的知识分子是后继者的财富，也是后继者的幸运。

后来大陆大力宣传的许多科学家，像竺可桢、华罗庚、李四光等，都来自中央研究院。他们都是中央研究院的旧班底。

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