原种、栽培种制作的注意事项
培养基含水量
食用菌菌丝体的生长发育与培养基含水量有关，只有含水量适宜，菌丝生长才能旺盛健壮。通常要求培养基含水量在60％--65％之间，即手紧握培养料，以手指缝中有水外渗往下滴1--2滴为宜，没有水渗为过干，有水滴连续淌下为过湿，过干或过湿均对菌丝生长不利。
培养基的pH
一般食用菌正常生长发育需要一定范围的pH，木腐菌要求偏酸性，即pH为4--6，粪草菌要求中性或偏碱性，即pH为7.0--7.2。由于灭菌常使培养基的pH下降0.2--0.4，，因此，灭菌前的pH应比指定的略高些。培养料的酸碱度不合要求，可用1％过磷酸钙澄清液或1％石灰水上清液进行调节。
装瓶（袋）的要求
培养料装得过松，虽然菌丝蔓延快，但多细长无力、稀疏、长势衰弱；、装得过紧，培养基通气不良，菌丝发育困难。一般来说，原种的培养料要紧一些、浅一些，略占瓶身的3／4即可；栽培种的培养料要松一些、深一些，可装至瓶颈以下。装瓶以后，用捣木（或接种棒）插一个圆洞，直达瓶底或者培养料的4／5处。打孔具有增加瓶内氧气、利于菌丝沿着洞穴向下蔓延和便于固定菌种块等作用。
装好的培养基应及时灭菌
培养基装完瓶（袋）后应立即灭菌，特别是在高温季节更应如此。严禁将培养基放置过夜，以免由于微生物的作用而导致培养基酸败，危害菌丝生长。
严格检查所使用菌种的纯度和生活力
检查菌种内或棉塞上有无真菌及杂菌侵入所形成的拮抗线、湿斑，有明显杂菌侵染或有怀疑的菌种、培养基开始干缩或在瓶壁上有大量黄褐色分泌物的菌种、培养基内菌丝生长稀疏的菌种、没有标签的可疑菌种，均不能用于菌种生产。
菌种长满菌瓶后，应及时使用
一般来说。二级种满瓶后7--8天，最适于扩转三级种，三级种满瓶（袋）7--15天时最适于接种。如果不及时使用，应将其放在凉爽、干燥、清洁的室内避光保藏。在10℃以下低温保藏时，二级种不能超过3个月，三级种不能超过2个月。在室温下要缩短保藏时间。
菌种杂菌污染的综合控制
?从有信誉的科研、专业机构引进优良、可靠的母种，做到种源清楚、性状明确、种质优良，最好先做出菇实验，做到使用一代、试验一代、储存一代。
?按照菌种生产各环节的要求，合理、科学地规划和设计厂区布局，配置专业设施、设备，提高专业化、标准化、规范化生产水平。
?严格按照菌种生产的技术规程进行选料、配料、分装、灭菌、冷却、接种、培养和质量检测。
严格挑选用于扩大生产的菌种，任何疑点都不可姑息，确保接种物的纯度。
?提高从业人员的专业素质，要规范操作；生产场地要定期清洁、消毒，保持大环境的清洁状态。
?专业菌种场要建立技术管理规章制度，确保技术的准确到位，保证生产。
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